吳怡農2月宣誓就任台北市黨部主委後，一直相當低調，這是他沉寂了大半年後首度打破沉默接受專訪。吳怡農說，去年台北市黨部主委陷入僵局，某天民進黨秘書長林錫耀打給他，問他是否有意選主委，當時他已成立壯闊台灣協會，專注在資安、演習、兵役等問題，他說，接到電話的第一時間「我覺得自己不太適合」，他也告訴林錫耀「相信有更好的人選」。
不過，這通電話也開啟了吳怡農一些想像，他開始思考一個黨的基層黨部應該長怎樣？能否連結社會與政黨。他說，很多人認為地方黨部是選舉期間啟動的選舉機器，但他去做了一些研究，發現英、美等民主國家的地方黨部，平時會不定期舉辦講座、組織議題、號召社區志工，是地方公民參與很重要的推動者，他不由德思考，是否可以讓黨部跟市民有更深連結，也透過這個連結，讓政黨更符合民眾期待。
當時吳怡農其實諮詢過不少朋友、長輩的意見、很多人都勸吳怡農不要選，他的團隊也相當反對。畢竟吳怡農過去對地方派系不熟悉，況且去年5月北市主委暫停時，情況相當複雜。
不過，吳怡農想到自己剛辭去香港工作回台時，曾以公民記者身走訪台灣各處，當時，他看到很多人用自己的方法在為這塊土地努力，而他考慮後發現，主委工作的重要性不亞於立委，立委代表人民單獨從事政治工作，主委則可以號召人民一起參與政治；投入主委選舉，也可以推動一些改變，讓政治環境更符合他當初走訪台灣看到那些人的期待。經過這樣的考量與轉折，吳怡農決定「跳下去選」。
吳怡農在農曆年前宣誓就職主委，4月27日趙介佑黑道入黨風波爆發，他坦言「碰到了之前沒有預期的狀況」，但回顧5個月前的這些風波，吳怡農說，事發當天黨部就宣布一定會處分，而在堅持掃除黑道的同時，「我們也很在意程序正義」，他舉例，當初國民黨的馬王政爭，就是因為程序問題，衍生許多枝節，照程序第一時間雖沒那麼便利，但是必要的事情。
吳怡農說，地方黨部除名黨員照規定要有3天通知期，他可以接受外界批評他政治手腕、處理方法要改進，但刻意操作「市黨部被派系把持」說法，他認為相當惡意，他完全不能接受。他強調，現在回頭來看，事實證明當初除名的處理很周全，事後沒有任何爭議。
吳怡農也說，這件事情讓他想起自己參選主委的初衷，他強調「市黨部應該是市民的黨部，而非任何派系的黨部」，應該服務黨員，更應該服務市民。
