李應元今年8月因健康為由請辭駐泰國代表，返台時被拍到他的身形爆瘦，上個月又被傳出罹癌病逝，民進黨立委管碧玲急忙出面代為澄清，強調他正在接受治療當中，許多綠營好友也紛紛幫他集氣加油，綠委陳明文憶起2人的革命情感，盛讚李應元待人溫暖，也立場鮮明，甚至在戒嚴時期曾被國民黨政府列為黑名單，「為台灣的民主和自由不間斷地在奮鬥。」希望他能早日對抗病魔。
前總統陳水扁今（12日）也公開一則影像，是他上個月12日在台南錄的影音，請李應元過去在環保署任職期間的幕僚代為轉達，內容說到：「應元兄，阿扁非常思念您！我來看您好嗎？排一個時間。希望您可以很快好起來！」向李喊話要一起加油。
然而李應元仍在昨天不幸辭世，2人再也無法相約敘舊，讓陳水扁相當悲痛，感嘆「如今應元兄再也排不出時間，也不會再好起來。今後在天上在人間，為了台灣，作伙再加油！」
李應元一生奉獻公職，也曾因主張台灣獨立被國民黨政府列為黑名單無法返國，1990年他以偷渡的方式回到台灣，還在總統府等地拍照，激怒當局，1991年被逮捕關押，1992年《刑法》100條修正，主張台獨不再被視為叛亂，才因此出獄。
李應元在扁政府時期曾出任駐美副代表，也被延攬入閣2度出任行政院祕書長一職；2002年代表民進黨參選台北市長，敗給爭取連任的國民黨時任市長馬英九；2016年蔡政府上任後，被任命為環保署長、後在2018年因空汙問題負起政治責任請辭；2020年5月應蔡總統請託，出任駐泰國代表，但僅到職1年就以健康為由請辭返台，本月11日晚間病逝台大醫院。
