特別的是，《集合！》定位為商業少年漫畫，沒有艱澀的學術內容，每集從一個台灣歷史事件出發，由學者提供素材，「編劇從中選取想要的元素，再轉譯成劇本。」陳澄波文化基金會董事長陳立栢強調，史實可能只占10%，其餘是虛構的情節，就像「置入性行銷」，前提是漫畫要精彩，才能寓教於樂。
每集故事都有核心理念，第一集《打了三百年》講述台灣原住民射日神話，台灣編劇竹本貞子表示，除了戰鬥、夥伴等熱血元素，由於原型故事描述3名年輕人揹著嬰兒跋涉千里射太陽，小孩在路程中逐漸長大成人，接續使命，因此以「傳承」為宗旨，劇本修改8次才定案。另外，科普也是內容的一環，例如故事提到「弓箭製作」與「鑽木取火」，「就會順著劇情在適當時機呈現先民如何將科學原理使用在生活中。」
作品末頁有一個800字的小欄目「出發點」，說明故事取材自哪一段歷史。陳立栢表示，這段補充資料有助《集合！》進入校園，希望藉此讓老師接受漫畫。他指出，為了與教科書內容區隔，不少素材取自民間記載，面向廣泛，例如英國傳教士萬榮華將足球運動帶進台灣、白色恐怖受難者張常美的故事、烏魚產業及狂犬病的歷史等，都將在漫畫呈現，「為求資訊正確，田野調查必須是第一手資料，得考據當年的日記、文件等。」
