檢警緊鑼密鼓查案，三嫌陸續被突破心防供出實情，專案小組鎖定幕後指使者，是來自桃園市觀音區的芫吉公司負責人林韋吉，去年12月大動作搜索芫吉公司時，業者顯然有備而來，不但提出檢驗報告強調廢液經再利用程序後均達合格標準，對人體沒有腐蝕性，對環境也不會造成破壞，甚至當場將雙手直接放進廢液的儲存槽，試圖證明所言不假。
面對業者狡辯，檢警在河床附近採樣，驗出土壤及水源含有超標重金屬，對人體、植物或生態明顯有害，下游農田灌溉用水恐怕也遭汙染。專案小組另根據涉案司機說法及疑犯手機通聯內容，指向林韋吉與居間幫忙找土地及司機的施姓包商涉嫌重大，旋即將2人聲押禁見獲准，最後過濾相關證據才將林韋吉聲押獲准。
專案小組發現，林韋吉以每公噸4,200元再利用處理費向上游電子工廠報價，載走強酸廢液後，實際上卻未依程序處理，即轉手以每公噸1.800元賣給施姓包商處理，賺取中間鉅額價差。
該名包商為了牟利，再以每趟車4萬元代價，透過貨運曳引車行老闆找司機載至指定地點棄置，層層剝削下，司機深知是非法傾倒廢棄物，仍冒著被抓的風險，半夜摸黑開車棄置有毒物至指定地點，每趟僅從車行老闆手中領到5千元，至於配合提供土地的地主或管理人，則收取每車廢液2萬元現金。
遭踢爆對生態釀成巨災的芫吉公司，成立於2007年，主要業務為回收廢酸洗液，每月回收再利用最大量達3,500公噸，標榜環保及服務人群為己任，如今看來格外諷刺；尤其芫吉早在2016年就涉及一宗廢酸洗液汙染案，當時將高雄市林園濕地公園的潟湖染成黃紅色，導致大量魚類、倒立水母死亡，造成生態浩劫，時任掛名負責人遭判刑1年5月，緩刑確定，如今橫跨三縣市濫倒廢液，手法更為惡劣，顯然沒有悔過之意。
