國土交通省指出，此次事故列為飛機事故，已向日本交通安全委員會通報，現階段優先考量機組人員以及旅客的生命安全，尚無從日航收到關於事故的任何說詞或報告，僅能得知當時該架日航客機準備自南面降落在C跑道，但降落之際，跑道上有一架海上保安廳的飛機，隨後2架飛機相撞，但碰撞如何發生還待釐清，現階段無法確定是自後面或側面撞上。
民航局長說，目前事故原因交由國家運輸安全委員會調查釐清中，在維護現場證據之虞，也會盡力在今晚恢復機場運作。
媒體問及事故發生前是否有任何異狀，海上保安廳副廳長回應，並未收到任何報告，指出飛行前並未出現任何異狀。
海上保安廳副廳長則說，向此次事故受影響的所有人致上最深歉意，對於罹難者深表遺憾，願逝者安息，向罹難者家屬致上最誠摯的哀悼，同時盡最大努力調查事故原因。
