回顧陳菊的病情發展，她2024年底因重感冒前往醫院就診，順道進行例行性健康檢查時，意外發現右側腎臟長有1顆約3.5公分的腫瘤。雖然隨即安排手術並順利切除，但在原定出院的前1天，陳菊突然出現右下肢無力症狀，經院方緊急檢查後，確診為左側腦血管阻塞。自此，她便入住高雄醫學大學附設醫院接受治療與復健，住院休養迄今已逾1年。
在陳菊長期住院期間，外界曾對其薪資領取狀況提出質疑。對此，監察院先前已澄清，陳菊院長的病假程序均依規定辦理，且她在請假期間每月均主動放棄約36萬餘元的薪資。
據了解，陳菊過去曾向總統賴清德表達請辭意願，但當時並未獲准，直到今日總統府正式發布免職令，確認其辭呈獲准。
