彭文正自訴指出，蔡英文並未依英國倫敦大學政經學院相關規定取得法學博士學位，也未完成博士論文及口試程序。他自2019年起在政論節目中持續質疑蔡英文學歷，之後蔡英文因相關言論對他提起加重誹謗告訴。彭文正則反過來主張，蔡英文為使他陷入刑事官司，將在倫敦政經學院期間的研究資料整理裝訂，於2019年9月26日送交國家圖書館，並授權存入博碩士論文系統供人閱覽、下載，因此涉嫌登載不實公文書罪。
不過，台北地方法院審理後認為，彭文正是否涉及加重誹謗罪，關鍵在於他當時是否已盡合理查證義務，與蔡英文送交國家圖書館的資料內容是否屬實，兩者並無必然關聯。法院也認為，彭文正所指蔡英文的行為，並沒有在犯罪發生當下直接侵害彭文正的法益，因此認定彭文正並非本案犯罪的直接被害人，自訴不合法，判決不受理。
案件上訴至台灣高等法院後，高院同樣認為，即使彭文正所描述的犯罪事實全部屬實，直接受到侵害的應是國家圖書館對博碩士論文系統資料管理的正確性，而彭文正既不是相關論文的撰寫者、名義人，也不是其他可以主張權利的關係人，難以認定其自身法益因蔡英文的行為直接受到損害，因此駁回上訴。
高院另指出，彭文正遭檢方依妨害名譽罪嫌起訴後，因審理期間滯留美國未返台、未依通知到庭，之後遭法院通緝，屬於彭文正個人的訴訟行為，以及法院依個案判斷是否有通緝必要性的職權行使，與他所指控的蔡英文送交論文資料一事並無關聯。
此外，法院也認定，蔡英文送交國家圖書館的相關資料，並未被檢察官採為起訴彭文正加重誹謗罪的證據，因此彭文正主張自己的訴訟權益因該資料受到損害，亦難以成立。
彭文正不服二審判決，再向最高法院提起上訴。最高法院審理後認為，原審認定並無違誤，彭文正的上訴不合法，今（14日）正式駁回上訴，維持自訴不受理結果，全案確定。
