行政院長賴清德隨即也表示，同意吳宏謀的說法，他也對外界說，台鐵改革是全面、徹底的改革。鄭寶清強調，台鐵內部有很多問題，一定要打掉重練，不要怕得罪人。
賴清德說，此次事件看得出台鐵本身不足，包括行安會自行調查得不到外界支持，所以未來政院要成立運輸安全委員會。而台鐵內部改革有重重困難，所以他也請政委張景森督導體檢，讓外界客觀、專業的力量介入，否則光靠局長要推動改革，內部各種意見紛歧，也很難推動，除慎選局長，也要靠外部力量協助。
鄭寶清追問，未來國家運安會成立後，對過去發生的事故、舊案會不會重啟調查？賴清德說，會尊重未來成立的運輸安全委員會，過去的事故如果要調查、對未來改進有幫助，都會尊重。
