指揮中心日前拍板機組員檢疫從原先的「5+9」（居家檢疫5天採陰後再自主健康管理9天），放寬為「3+11」（居家檢疫3天採陰後再自主健康管理11天），沒多久後就爆發機組員染疫，華航諾富特飯店也發生群聚感染，之後燒向雙北、宜蘭，至今仍每日都有百例本土確診個案，因此不少人都將矛頭指向指揮中心的決策，提案的民進黨立委范雲也遭罵翻。
對此，陳時中日前於立法院備詢時聲稱該案決策會議是由副指揮官陳宗彥主持，卻被踢爆陳宗彥根本沒參與相關會議，事後陳時中才表示「記錯了」，改口表示由自己負責這個決定。不過，該項決策卻未做成會議記錄，再度引發熱議，監察院也在今早表示將對此案進行調查。
陳時中則在今日疫情記者會上回應指出，基本上每天的會議這麼多，沒辦法每樣都做成會議紀錄，且之後也都會走公文程序，所以沒有要求每場會議都必須要紀錄，每天案件都非常多，行政上不完備的地方請監委見諒。
