林口長庚醫院臨床毒物中心主任顏宗海指出，馬鈴薯一旦發芽或表皮轉綠，可能產生具有神經毒性的「龍葵鹼」，即使僅少數發芽，也可能汙染同批正常馬鈴薯。他說明，人體若攝入每公斤體重2至5毫克龍葵鹼，便可能出現中毒症狀；若達3至6毫克，甚至可能危及生命。目前並無專門解毒劑，臨床多以支持性療法處理，也就是症狀治療，以腸胃道用藥緩解不適，如呼吸困難時則給予插管。
不過，由於龍葵鹼本身帶有苦味，民眾在食用時若感覺味道不對，多半會立即吐出，因此較少發生嚴重中毒的情況。我國目前將龍葵鹼容許值訂為200ppm，與美國相同，顏宗海表示，只要同批馬鈴薯未超過此殘留值，基本上都沒問題。
過去台灣對進口馬鈴薯採取較嚴格標準，只要發現發芽即整批退運；不過依ART協定，未來將改為單顆剔除即可。農業部表示，此舉是為與國際接軌，日本等國亦採取類似方式，並強調後續會由加工廠逐顆人工篩選，確保不良品被剔除。然而，逢甲大學國貿系教授楊明憲認為，涉及食安疑慮的檢疫標準不宜放寬，質疑單顆剔除是否足以確保整批產品安全，並指出各國檢疫制度本就不同。
