全片從發想到完成歷時5年，總製作經費約新台幣1,200萬元，資金來源包括群眾募資（約占50%）、日本電影發行商太秦株式會社投資（占15%），其餘為各國影展的補助，以及由陳梓桓與監製任硯聰自付的初期拍攝費用。
任硯聰表示，《憂鬱之島》仍在宣傳期，由於獲本屆加拿大國際紀錄片影展最佳紀錄片，已具備資格報名明年奧斯卡最佳紀錄片，因此相關行銷費用仍持續增加中。
陳梓桓談及與日方的合作淵源時透露，雙方2017年結緣於日本山形國際紀錄片影展，當年他帶著《亂世備忘》參展，拿下鼓勵亞洲紀錄片新導演的「小川紳介獎」，隔年太秦負責該片在日本上映宣傳，也允諾金援陳梓桓的新片計劃。
群眾募資有近3,000人匿名參與，首波目標設定港幣80萬元，一個星期就達標，總計募得約港幣160萬元，扣除手續費後實拿港幣150萬元（約新台幣590萬元）。除了用於拍攝，也支援電影的後製、參展和宣傳費用。
眾籌和日本資金之外，任硯聰與陳梓桓也跑遍各國際影展的提案會議，包括釜山影展、韓國國際紀錄片影展等17個，從中得到的獎金累積起來不無小補。首次嘗試以此方式籌資的任硯聰說：「我們邊拍攝、邊籌錢，只要劇組有需求，就盡力尋找資金配合。」
