檢方偵辦全案，訊問黃女13次，黃女都矢口否認縱火，但根據周邊監視器畫面，案發凌晨2點16分黃格格離開起火隔間，至劉姓計程車司機發現白煙竄出時，都無人靠近該間隔間，且與黃飲酒的證人說法，案發前黃確實有點沉香驅蚊。
且黃與郭爭吵時，郭曾說燒一燒也沒關係，因為房子不是他的，又黃女在案發前傳訊給郭，稱「你想看的事情，我一定做給你看」、「這一次一定不會騙你」，檢察官認定黃女講的就是放火燒屋。
法官審酌檢方證據，認為黃格格是最後一人離開隔間，且在火警發生前，隔間都無人靠近，認定火警是由她引起，因大樓防火門未發揮作用，才造成災情慘重，觸犯放火罪。
至於殺人罪部分，法官則認為起火點距離住戶至少20公尺以上距離，黃縱火是因與郭姓男友發生爭執，才蓄意破壞郭男借住的隔間沙發，認為她無加害住戶的殺人故意，不成立殺人罪，因此僅依放火罪，處該罪最重無期徒刑，褫奪公權終身。
黃格格羈押高雄女監未到庭聆聽，但一名黃姓死者家屬聽到僅判無期徒刑，一度在庭外崩潰「46條人命判無期徒刑？沒辦法接受判決結果，應該用殺人罪判死！」
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