檢方調查，陳堯俐自2008年起，非法安排9名病患到中國進行移植手術，其中一人花了1400萬元，結果術後不到2週就去世，另外3人2年內離世，1人也在術後5年過世。檢方掌握證據後，前年將陳起訴、求刑6年，移審法院。
一審法官認為，陳堯俐身為移植名醫，卻利用病患求生心態牟利，嚴重違反器官移植無償原則，但考量他坦承犯行、全數繳回犯罪所得，應無再犯之虞，將陳判處2年徒刑，緩刑5年，罰金500萬元，並沒收不法所得1466萬元。
檢方不服，上訴二審，強調「器官提供者」意願難以確保，且涉及活摘器官等議題，嚴重影響台灣國際形象與衛生醫療交流，不宜宣告緩刑，應該讓陳堯俐入獄，才足以彰顯我國注重人性尊嚴之價值。二審時，陳供稱，初衷是以病人安全為主，並非營利，知道做錯，現在在多家醫院做技術指導，希望法院給予緩刑，讓他繼續在醫界貢獻。
陳堯俐的律師也說，手術均在中國合格醫院完成，且依中國醫療法進行，陳不是單純仲介，加上沒有證據顯示器官是買賣而來，陳對醫學界貢獻良多，且犯後態度良好，應該給予緩刑。台中高分院審酌後，認定陳堯俐坦承犯行，並繳回全數犯罪所得，經刑事追訴程序後，應知警惕、無再犯之虞，上個月駁回檢方上訴，維持緩刑判決，全案還可上訴三審。
本刊調查，陳堯俐原本在彰化基督教醫院服務，案發前2年，院方就掌握不法證據，將他解聘，陳當時矢口否認，還反咬彰基總院長陳穆寬故意栽贓。離開彰基之後，陳堯俐獲聘擔任中山醫學大學附設醫院副院長，但他遭起訴、判刑之後，已被拔掉副院長頭銜，不過，目前依舊在醫界服務，擔任中山醫學大學附設醫院消化外科、秀傳醫院一般外科的主治醫師。
