外交部表示，本案發生後，外交部第一時間責成兼轄烏干達的駐索馬利蘭代表處密切掌握，並與當地台商會建立聯絡管道，積極與烏國政府及機場移民當局展開溝通交涉。經過多方努力，烏國機場移民局已於當地時間8月19日正式將遭留置的4本我國護照全數發還給國人。
針對國台辦藉此事件宣揚「一中原則」、矮化我國主權，外交部發出嚴正聲明重申，中華民國台灣是主權獨立國家，與中華人民共和國互不隸屬，中共政權從未統治過台灣一天，這是國際客觀公認的事實。中方藉機進行政治炒作的謬論，不僅無法改變兩岸互不隸屬的現狀，更再次向全世界凸顯其對外施壓的威權本質。
外交部最後呼籲，各國政府應秉持專業與務實原則，排除不必要的政治干擾，尊重中華民國合法護照與旅行文件，以確保雙邊正常的經貿與民間交流權益。
更多《鏡新聞》報導
烏干達強迫台人持中國護照蓋章 IPAC號召23國66議員發聲挺台
台灣影人遊埃及被控「偷文物」！嘆像國際孤兒 外交部急援助
台學者遭肯亞關押20小時 隔欄杆教警衛「中國愛沒有心」酸爆中共
