秦剛最後一次出現在大眾視野，是6月25日於北京會見斯里蘭卡、俄羅斯與越南的官員。之後多場重要外交場合，包括在印尼雅加達舉辦的東亞峰會和東協論壇，秦剛也請假缺席，改由中共中央政治局委員、中央外事工作委員會辦公室主任王毅代打。
由於中國官方並沒有對秦剛「請假」的原因，做出正式回覆，因此引發外界議論紛紛。先前傳出秦剛是因為確診新冠肺炎而消失，但由於秦剛已經超過2周沒有出現，因此若真的是染疫，那就代表秦剛的狀況算是嚴重，或者也有可能秦剛是染上其他疾病。另外，在本月7日的記者會上，就有外媒詢問秦剛是否因為健康問題而消失於公眾視野，但當時中國外交部發言人汪文斌的回應是：「我並沒有聽說你講的這個情況。」
因此除了「健康說」，現在開始有一派推測，認為秦剛可能涉及「美女關」因此中箭落馬，就有網友點名《鳳凰衛視》美女主播傅曉田可能與秦剛「過從甚密」，傳出不倫戀的緋聞。不過也有網友認為，按照中國官場的作風，如果此人官位夠大、背景夠重，情色、貪腐根本只是點綴，絲毫不能動搖當事人的地位，相關新聞也一定會被蓋過。所以有網友認為，秦剛「被消失」可能不只是單純的情色緋聞就能動搖，背後可能還有更多、更大的「祕密」。
