庭訊時，蔡正元強調，遭押近4個月無法與親友聯絡，帳戶也遭凍結，籌措金額有限，但在律師協助下願盡力提供一定金額的擔保金，日後偵審他均會出庭；檢方指出，本案相關共同被告、證人已陸續到案，蔡正元應已無勾串共犯、證人之虞，但有逃亡之虞，檢方因此向法院聲請讓蔡正元交保，法官則裁定千萬元交保，蔡正元的律師林合民說，因蔡正元的帳戶都遭凍結，1,000萬元是向親友籌借而來的。
檢方查出蔡正元涉在2006年擔任立委期間，找郭台銘弟弟郭台強妻羅玉珍和莊婉均協議，向國民黨中投公司買中影8成股權，同年7月，蔡正元擔任中影董事長，召開股東臨時會決議授權董事會辦理減資，減資5.8億元信託給蔡掌控的阿波羅公司。不過，蔡後來又代表阿波羅簽約，把部分減資款再信託給自己，涉挪用其中2,000萬元投資南港無雙豪宅、逾5,000萬元買信義區豪宅、8,000萬買股票等，另付信用卡費約300萬元，還有上億元流入蔡正元和洪菱霙在香港的帳戶。
檢方在清查資金流向後發現，蔡正元夫妻多有以現金提款、存款方式製造斷點，以隱匿金流增加追緝的難度，檢方僅在蔡正元家中，查扣阿波羅公司2007、2008年度帳冊，其餘部分並未扣得，蔡正元雖說稱與他無關，非由他管理，並強調此案是政治迫害，因對於香港帳戶的管理過程蔡正元與妻洪菱霙說法不一，蔡正元於7月18日遭羈押禁見，洪菱霙因懷孕即將生產，獲300萬交保，並已於11月初產下一女嬰。
檢方除了偵辦既有的阿波羅公司背信案緊咬蔡正元外，另查出中廣等交易案也有問題，日前不但首度搜索中投公司，連居中鑑價衡平資產管理公司也成為被調查的對象，包括前行管會主委張哲琛及前中投總經理汪海清等人都被偵訊過，時任黨主席、前總統馬英九可能隨時都是下一個被約談的目標，因蔡正元4個月羈押期將屆滿，檢方先向法院聲請讓他具保停押，再進行後續偵查。
