特偵組2008年起訴陳水扁，罪行包括國務機要費等數個不同的犯罪區塊，其中龍潭購地收賄、賣官收賄、海角7億洗錢、2次金改等4大案遭法院判刑20年定讞入獄，扁所涉尚未定讞的國務機要費案、二次金改國泰併世華收賄弊案、教唆偽證、侵占總統府機密公文案及洗錢案等5大案，則分散在高等法院及台北地院審理中，後來都因扁稱病全部停止審理中。
去年5月，扁北上參加凱校募款餐會，並發表錄影談話，承審二次金改案的高院法官曾德水認為有必要了解扁是扁可以上法庭受審，因為依據高雄長庚醫院去年5月4日的診斷報告及陳順勝教授去年5月24日回覆台中監獄文件，扁對於過去政治及法律領域表達順暢，也有強烈主動性，報告中提及，扁對政治及法律議題分析有相當優越表現，如在去年12月對於聖多美普林西比與台斷交及女兒陳幸妤診所開幕，扁均會主動關心新聞報導。
此外，依據陳順勝教授的報告，扁從去年4月進行「陳水扁口述歷史」也已完成，即將出書，第二階段口述歷史訪談也由國史館計畫中，曾德水問檢察官，扁以語言有障礙為由停審，卻又能口述歷史，曾德水於是發傳票請扁出庭，但扁未出庭，並聲請換法官，已遭最高院駁回。
扁因健康因素無法出庭，但活動力不減，去年底曾出席簽書會，今年1月間，當時的監委被提名人陳師孟表示將替扁申冤，同一時間，扁則北上前往翠山莊，為96歲大壽的前總統李登輝祝壽，事後網路又瘋傳阿扁與友人聚餐時一直要求大家不要PO網的影片及「摟妹照」，日前扁更是在高雄替兒子陳致中站台，讓陳致中選情大好，聲勢漲到高點，司法被卻因扁重重打臉，公信力已降到低點。
