原來，被殺的彭姓騎士某次與友人飲酒後曾哭著說：「我活不長了，萬一哪天出意外，請告訴警察是吳新華這幫人幹的！」警方調查，死者曾幫吳銷贓，吳的同夥還曾拿二把長槍交給彭保管，這二把槍就是湖口雙哨命案失蹤的步槍。線民告訴警方，雖然彭知道雙哨命案就是吳新華集團幹的，但他不敢說，也沒辦法畫清界線，加上吳曾放話要對彭不利，彭才會擔心不已。
同年底，新竹光復路一家銀樓發生搶案，老闆娘當場被殺，歹徒逃跑時，被一名計程車司機尾隨跟蹤，警方獲報圍捕，逮到多名吳新華集團同夥，但吳不在其中，警方隨後到吳的住處找人，一進屋發現他正在磨刀，神情自若，面對警方有問必答，不見異樣，因無法證明他參與犯案，警方只能收隊離開。
不過，偵辦期間，有目擊者指認吳新華犯下街頭殺人案，搶銀樓的同夥也供出吳是主謀，警方取得關鍵證詞後，前往逮人，但吳早一步跑了，並躲到新竹寶山一處農場藏匿，警方後來循線找到該農場，他已逃之夭夭。蔡世一說，警方在農場發現許多狗屍體吊在樹上，且每棵樹都被刀射得面目全非，懷疑吳在農場殺狗練膽、射樹練刀。
此外，警方還在現場發現二本雜誌及一副假鬍子，其中一本雜誌寫到湖口雙哨命案，另一本則有當時台灣省議員林義雄家族的林宅血案相關報導，由於林宅血案的目擊者指出，歹徒有鬍子，而吳新華戴上假鬍子後，很像歹徒，加上林宅血案發生在1980年，與吳流竄犯案的時間點相近，諸多巧合讓警方懷疑吳除了雙哨命案，也涉及林宅血案，吳可能想透過雜誌報導，掌握辦案進度。
雖然林宅血案歹徒的犯案手法，與吳新華集團慣用手法雷同，但因為沒有直接證據，加上戒嚴時期，事涉敏感，案件非警方主導，最後不了了之。
為緝拿吳新華，警方佈下天羅地網，最後喬裝槍枝賣家，成功在桃園某飯店逮到他。1988年，法院依強盜殺人等罪，將吳家3兄弟及其他4名同夥判處48個死刑，吳新華一人被判10個死刑，創下紀錄。定讞後不久，吳被執行槍決，沒想到他心臟偏右，法警開了5槍才斷氣，結束他罪孽深重的一生。
