對於中國認定台灣對中貿易限制措施存在《對外貿易壁壘調查規則》第三條情形，構成貿易壁壘，行政院經貿辦今回應，表示中國對台灣片面進行貿易壁壘調查並宣布調查結果，已違反世界貿易組織（WTO）相關機制與規範且不符事實，無法接受。
經貿辦也呼籲中方停止政治操作，強調兩岸同屬WTO會員國，相關貿易問題可依WTO機制與相關規範有效處理，若中國有誠意，雙方隨時可循WTO機制啟動協商，共同面對解決貿易的爭端。
經濟部也表示，中國先前多次無預警暫停進口台灣農漁產品及食品，為因應中國可能突發之各種政策風險，已和業者溝通且進一步推演、盤點可能的影響情況，並已啟動相應措施，以確保業者權益。
目前經濟部規劃強化分散市場、提升產品差異化能力等2大面向措施，協助業者透過海外參展、運用數位科技、擴大貿易金融資源等方式爭取商機，希望達到推動產業高值化、低碳化及智慧化以促進業者升級轉型的目的。經濟部也強調，無論未來如何發展，都會透過各種政策工具，積極協助業者因應。
至於陸委會則是表示，不能接受陸方違反WTO規範，片面對我進行「貿易壁壘調查」之政治操作行為，兩岸都屬於WTO會員，任何貿易爭端都該循WTO機制處理才是正途，陸方刻意繞開WTO貿易爭端機制明顯有政治目的。
陸委會也稱，若陸方對兩岸貿易有不同看法，應該遵照WTO爭端解決機制與程序進行糾紛調處，以共同維護兩岸整體經貿交流的良好氛圍。
