海洋大學商船系助理教授徐元和表示，日本一直很介意船隻行經釣魚台附近海域，只要航行通過，上空一定有海上保安廳的直升機在附近監控；徐元和10年前擔任育英二號船長時，一名船員在船後方使用繩索與鉤子趁著船航行時，想釣鬼頭刀來加菜，但這麼小的動作也被日本掌握，事後對此表達抗議；之後學校直接拆掉船後方的拖網機等漁撈設備，避免日本誤以為公務船有在釣魚台進行漁業活動，沒想到都做到這樣了日本還是有意見。
根據基隆海事的統計，育英二號之前是漁船育英號，從1981年起利用寒暑假期間帶學生上船實習，育英號服役20年共航行138航次，因為船齡老舊才由台船打造新船，如今育英二號也服役超過20年，目前教育部也正開始計畫打造育英三號，希望未來接替育英二號的任務，繼續擔任全國唯一的實習船。
國教署表示，雖然這次受到日本方面的壓力，但海事學生的實習不可能中斷，只要維持航線，避免侵入爭議海域，依舊會讓大專與高職學生上船實習。
