本刊調查，自雙北乃至於其他縣市陸續設立快篩站後，因目前確診者判定仍以核酸檢測為依據，快篩陽性者雖都暫時移往集中檢疫所或縣市防疫旅館隔離，但等待核酸檢測結果出爐約有至少3天的時間差，這段時間因相關接觸者無法匡列而產生空窗期，增加傳播及感染風險，等待者及親友也人心惶惶，有的還主動赴快篩站採檢。
另一個空窗期是篩檢大塞車，大筆校正回歸確診的個案，也可能被延遲隔離，直到判定確診當天，衛生單位才會介入要求隔離。台灣感染症醫學會名譽理事長、台大兒童醫院院長黃立民說，等待核酸檢測結果約需3至6天，快篩陽性者因不是法定確診者，無法依法開立居家隔離書，親密接觸者也無法被隔離，只能衛教規勸自主管理，等報告出爐後才回頭匡列，「對圍堵疫情就是慢了！」
他表示，若直接把快篩陽性者判定成確診者，雖可解決時間差，但快篩有偽陽性，被犧牲的可能就是受檢者與相關接觸者的人權，「都必須關（居家檢疫）14天！」若可採檢測速度更快的機器，引進30分鐘可驗出結果的核酸快篩儀器，就可解決這樣的困境。
前疾管局長蘇益仁則主張，防疫必須把公衛手段與醫療處置區分開來處理，從公衛防疫角度，既然已做了快篩，那就不必再浪費篩檢量能再做核酸檢測，除非遇到重症或需要進入醫院治療的病患，為了精準研判病症，屆時才需要加做核酸檢測確認，如此一來，就可紓減目前塞車的篩檢量能。
