現行判定確診的依據是核酸檢測（PCR），即便在快篩站也同時採核酸檢測雙重驗證。是否評估將熱區內的快篩陽性者直接判定為確診者？指揮中心發言人莊人祥接受本刊採訪表示，內部的確有討論過，但最後決定不採用；快篩陽性若要直接判定為確診，最可能的方式是比照登革熱快篩模式，只鎖定在感染盛行區實施，但仍需有配套。
他直言，要將快篩陽性者直接判定為確診者，「這在操作定義有點困難」，因登革熱是透過蚊子傳播，與環境息息相關，可直接定義何謂盛行區，但武漢肺炎是飛沫傳染，人會移動，如何界定盛行區？此外，近期朝陽科大夜唱群聚案，快篩驗出29人陽性，再送核酸檢測卻全數陰性，快篩偽陽性的問題也要納入考量，因此目前快篩陽性者會列入通報，但仍採核酸檢測雙重驗證才能判定是否確診。
對於確診判定時間差導致的空窗期，莊人祥說，目前快篩陽性者都會被送往集中檢疫所或各地防疫旅館，有些直接驗核酸檢測的個案的確要等到被判定確診後才會處置，但都會要求他們在等待結果出爐的3天內避免外出且自主健康管理；至於快篩陽性者的密切接觸者，也已提醒若有症狀要儘速採檢。
此外，因應愈來愈多的快篩站設立，指揮中心已簡化篩檢資料上傳的流程盼縮短篩檢時間差，另請疾管署昆陽實驗室就市面上的快篩試劑進行平行試驗與統計，了解哪個快篩試劑最符合需求。衛福部健保署近日也改版「健保快易通」APP中的「健康存摺」功能，23日起已可登入查詢篩檢結果，快篩約採檢後1小時、核酸檢測結果則在採檢後3日內可查詢。
