台鐵指出，住友交付的傾斜式電聯車有主風泵設計不良、列車自動防護系統（ATP）遠端監視系統未連線等缺失，進而導致普悠瑪事故，因此向住友索賠乘客傷亡、列車毀損、設備損害及營業損失，合計6億1,211萬餘元。
不過住友表示，事故當天主風泵運轉異常的原因為台鐵未妥善維修、定期更換零件、保養列車，並非設計缺失所致；而新馬站彎道限速為75公里，但當時列車卻以高於速限2倍、時速141公里高速通過，強調這才是事故肇因，並非因ATP遠端監視系統未連線所致，且ATP遠端監視系統本身並無減低行車速度，或於ATP系統遭隔離時重啟ATP系統的功能，列車安全速度的維持，主要在於司機員確實遵守各區間速限。
台北地院審理後指出，主風泵異常將導致列車車速降緩甚至停駛，與普悠瑪事故因超速翻覆之間，顯然不存在任何條件關係，且台鐵提出的報告也僅把主風泵設計不良列為事故遠因，並非直接原因；另外，台鐵在2014年完成普悠瑪驗收，到事故發生前均未曾驗收ATP連線功能，亦未發現異常，報告中ATP遠端監視系統為連線也僅是事故發生的間接原因，認為事故原因為統合諸多行為人的行為與機器設備累積作用的結果。
台北地院認為，台鐵並未舉證主風泵設計不良、ATP遠端監視系統未連線等缺失，且台鐵發現列車異常後，應立即停止使用列車，但卻沒有任何處理照常出車，依據通聯紀錄，司機員曾反映列車異常，不過當時福隆站長卻轉知行車調度員「可以動就盡量跑」，對於行車安全置若罔聞，即使住友商事主風泵設計不良，也無從認定會造成同樣損害。
台北地院最終判台鐵敗訴，住友不需負擔賠償責任。可上訴。台鐵則表示，會在收到判決書後，與律師研議是否上訴。
