林智堅澄清自己的論文的原創性，強調是他提給研究資料給余正煌，對此北市議員王鴻薇反指，林的說法是在逼余正煌承認抄襲，因此她也向台大發出檢舉信，檢舉余正煌涉嫌抄襲，稱是要給余正煌出面說明的機會。
被捲入論文抄襲風波，余正煌沉默多日後終於發聲，資深媒體人黃揚明今在臉書公開余正煌的聲明，余強調自己的論文均按照學術規範自行撰寫完成，未有任何抄襲之情事，並已將相關事證交予台灣大學社會科學院學位論文違反學術倫理審定委員會，「外界所指本人之論文涉及抄襲之情，實與客觀事實不符」，日後若仍有不實指控、造謠抹黑或惡意中傷之情況，將依法訴追相關責任，並指出此案已委任律師處理，不再對外做任何回應。
對此，林智堅競選辦公室發言人黃韋鈞指出，林智堅自始至終都是在捍衛自己的論文絕無抄襲，沒有指責任何人有抄襲的情況，並重申陳明通教授上週的聲明內容，「林余二位都沒有抄襲的動機，這些相似與我的教學及指導學生論文寫作有關。」林智堅已委由黃帝穎律師提出台北地院所屬公證人的公證書相關資料，親自提出具有法律效力的實質證據，證明自己的清白。
黃韋鈞直指國民黨不斷胡亂抹黑、施壓中華大學及台大，干擾學術自主，呼籲國民黨停止將正智髒手伸向校園及公務機關，也期待台大社科院學倫會能秉持公正、公平的原則，完成相關案件的審定，還給林智堅清白。
