免治馬桶使用方便，不僅在住家普及，許多公共廁所也紛紛加裝。然而，專家提醒，若設備未定期清潔與妥善維護，恐成為細菌滋生的溫床，增加感染風險，尤其女性更需留意，嚴重時可能引發膀胱炎、陰道炎等感染性疾病。
根據韓媒《naver》報導，首爾大學微生物研究所針對公共廁所的馬桶坐墊進行病原體調查，共檢測出17種大腸桿菌、9種沙門氏菌，以及5種金黃色葡萄球菌。
研究顯示，每個馬桶坐墊平均檢測出71個細菌，在10公分乘以10公分的範圍內，更發現多達3800個細菌，「比地鐵扶手上的細菌數量高出11倍。」
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