4月5日晚間，高鐵台中路段發出無線電異常訊號，導致3列行駛中的列車緊急煞停並延誤，經調查相關訊號並非來自現場異常狀況，而是遭外部訊號干擾所致，高鐵隨即報警處理。桃園地檢署指揮偵辦，於4月28日拘提一名23歲林姓男大生到案，29日晚間訊後認定其涉案情節重大，但無羈押必要，諭令10萬元交保。
此外，外傳台鐵無線電系統疑似也曾遭入侵，引發外界關注。對此，台鐵公司強調，其行車無線電為封閉式系統，未與外部網路連接，並無遭駭情形。台鐵表示，已針對資訊設備I/O進行韌體加密，並定期執行資安弱點掃描作業；同時於年度維護中更新無線電終端設備密碼，並針對使用者操作界面加密，以保護系統設定參數不外洩。
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