南非電子旅行授權（ETA）系統自2025年10月起分3階段推動，首波提供中國、印度、印尼及墨西哥出席G20峰會人員線上申請簽證，接著於同年11月擴及上述4國一般民眾，第3階段則預計全面開放，但實施時程尚未公布。
不過，實際檢視南非電子旅行授權（ETA）網站可發現，註冊帳號頁面的「護照核發國」選單中，將中華民國國旗標示為「Taiwan, China」，電話國碼「+886」也被列為「Taiwan, China」。此外，網站更顯示台灣目前「未列入開放名單」，即使完成註冊，也無法申請電子旅行授權。
對此，外交部表示，電子旅行授權（ETA）屬於南非正式啟用電子簽證（e-Visa）前的過渡措施，目前僅適用中國、印度、印尼及墨西哥等4國公民，台灣民眾並非適用對象。依現行規定，國人赴南非仍須前往南非聯絡辦事處申辦紙本簽證，既有簽證申請程序未受影響。
外交部重申，「中華民國台灣是主權獨立國家，與中華人民共和國互不隸屬」，目前已指示駐南非代表處就電子旅行授權（ETA）系統錯列我國名稱一事，向南非政府表達嚴正關切與強烈抗議。
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